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如果苹果手机上的短信已经被彻底删除，恢复起来可能会有些困难，但并非完全不可能。以下是一些可以尝试的方法。
1、从iCloud备份恢复：
如果开启了iCloud备份，或许可以在iTunes中恢复已删除的短信，具体步骤如下：
打开iTunes并连接苹果手机。
点击设备图标，选择“恢复备份”。
选择最近的备份时间，然后等待恢复过程完成。
此方法会恢复备份中的所有数据，包括短信，但同时也可能包含其他数据。
2、使用第三方数据恢复软件：
市面上存在一些第三方数据恢复软件，如EaseUS MobiSaver等，可以帮助恢复已删除的短信，这些软件通常需要连接手机并扫描以查找已删除的数据，但请注意，使用第三方软件可能存在一定的风险，所以在使用之前请确保软件的可靠性并仔细阅读相关说明。
3、直接向运营商查询：
如果短信是与运营商的通信记录的一部分，可以尝试联系运营商查询是否有可能恢复已删除的短信记录，但这通常需要特定的条件和程序，并且并非所有运营商都提供此类服务。
无论使用哪种方法，都需要注意以下几点：
尽快采取行动，因为数据恢复的成功率可能会随着时间的推移而降低。
在尝试恢复之前，避免在设备上安装新的应用程序或进行其他可能导致数据覆盖的操作。
如果不确定如何操作，建议寻求专业人士的帮助以避免造成不必要的麻烦。
为了避免将来再次丢失数据，建议定期备份手机数据并开启iCloud备份功能。